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hv-anndata documentation
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  • hv_anndata
    • hv_anndata.A
    • hv_anndata.AnnDataInterface
      • hv_anndata.AnnDataInterface.aggregate
      • hv_anndata.AnnDataInterface.dimension_type
      • hv_anndata.AnnDataInterface.dims
      • hv_anndata.AnnDataInterface.groupby
      • hv_anndata.AnnDataInterface.iloc
      • hv_anndata.AnnDataInterface.init
      • hv_anndata.AnnDataInterface.reindex
      • hv_anndata.AnnDataInterface.select
      • hv_anndata.AnnDataInterface.selection_masks
      • hv_anndata.AnnDataInterface.unpack_scalar
      • hv_anndata.AnnDataInterface.validate_selection_dim
      • hv_anndata.AnnDataInterface.values
    • hv_anndata.Dims
      • hv_anndata.Dims.kdims
      • hv_anndata.Dims.vdims
    • hv_anndata.register
    • hv_anndata.GeneSelector
      • hv_anndata.GeneSelector.options
    • hv_anndata.ClusterMap
      • hv_anndata.ClusterMap.adata
      • hv_anndata.ClusterMap.cmap
      • hv_anndata.ClusterMap.max_genes
      • hv_anndata.ClusterMap.plot_opts
      • hv_anndata.ClusterMap.show_widgets
      • hv_anndata.ClusterMap.use_raw
    • hv_anndata.ClusterMapConfig
      • hv_anndata.ClusterMapConfig.cmap
    • hv_anndata.create_clustermap_plot
    • hv_anndata.Dotmap
      • hv_anndata.Dotmap.adata
      • hv_anndata.Dotmap.dendrogram
      • hv_anndata.Dotmap.dendrogram_opts
      • hv_anndata.Dotmap.groupby
      • hv_anndata.Dotmap.ls
      • hv_anndata.Dotmap.plot
    • hv_anndata.DotmapParams
      • hv_anndata.DotmapParams.expression_cutoff
      • hv_anndata.DotmapParams.kdims
      • hv_anndata.DotmapParams.marker_genes
      • hv_anndata.DotmapParams.max_dot_size
      • hv_anndata.DotmapParams.mean_only_expressed
      • hv_anndata.DotmapParams.plot_opts
      • hv_anndata.DotmapParams.standard_scale
      • hv_anndata.DotmapParams.use_raw
      • hv_anndata.DotmapParams.vdims
    • hv_anndata.ManifoldMap
      • hv_anndata.ManifoldMap.adata
      • hv_anndata.ManifoldMap.color_by
      • hv_anndata.ManifoldMap.color_by_dim
      • hv_anndata.ManifoldMap.colormap
      • hv_anndata.ManifoldMap.datashade
      • hv_anndata.ManifoldMap.height
      • hv_anndata.ManifoldMap.labeller_opts
      • hv_anndata.ManifoldMap.legend_alpha
      • hv_anndata.ManifoldMap.legend_font_size
      • hv_anndata.ManifoldMap.legend_ncols
      • hv_anndata.ManifoldMap.legend_position
      • hv_anndata.ManifoldMap.ls
      • hv_anndata.ManifoldMap.plot_opts
      • hv_anndata.ManifoldMap.reduction
      • hv_anndata.ManifoldMap.responsive
      • hv_anndata.ManifoldMap.show_labels
      • hv_anndata.ManifoldMap.show_widgets
      • hv_anndata.ManifoldMap.streams
      • hv_anndata.ManifoldMap.var_reference
      • hv_anndata.ManifoldMap.width
      • hv_anndata.ManifoldMap.x_axis
      • hv_anndata.ManifoldMap.y_axis
      • hv_anndata.ManifoldMap.create_plot
      • hv_anndata.ManifoldMap.get_dim_labels
      • hv_anndata.ManifoldMap.get_reduction_label
    • hv_anndata.ManifoldMapConfig
      • hv_anndata.ManifoldMapConfig.width
      • hv_anndata.ManifoldMapConfig.height
      • hv_anndata.ManifoldMapConfig.datashading
      • hv_anndata.ManifoldMapConfig.show_labels
      • hv_anndata.ManifoldMapConfig.cmap
      • hv_anndata.ManifoldMapConfig.title
      • hv_anndata.ManifoldMapConfig.responsive
      • hv_anndata.ManifoldMapConfig.streams
      • hv_anndata.ManifoldMapConfig.ls
      • hv_anndata.ManifoldMapConfig.labeller_opts
      • hv_anndata.ManifoldMapConfig.legend_position
      • hv_anndata.ManifoldMapConfig.legend_alpha
      • hv_anndata.ManifoldMapConfig.legend_font_size
      • hv_anndata.ManifoldMapConfig.legend_ncols
    • hv_anndata.create_manifoldmap_plot
    • hv_anndata.plotting.scanpy
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      • hv_anndata.plotting.scanpy.heatmap
      • hv_anndata.plotting.scanpy.tracksplot
      • hv_anndata.plotting.scanpy.violin
      • hv_anndata.plotting.scanpy.stacked_violin
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