Index A | C | D | E | G | H | I | K | L | M | O | P | R | S | T | U | V | W | X | Y A A (in module hv_anndata) adata (hv_anndata.ClusterMap attribute) (hv_anndata.Dotmap attribute) (hv_anndata.ManifoldMap attribute) aggregate() (hv_anndata.AnnDataInterface class method) AnnDataInterface (class in hv_anndata) C ClusterMap (class in hv_anndata) ClusterMapConfig (class in hv_anndata) cmap (hv_anndata.ClusterMap attribute) (hv_anndata.ClusterMapConfig attribute) (hv_anndata.ManifoldMapConfig attribute) color_by (hv_anndata.ManifoldMap attribute) color_by_dim (hv_anndata.ManifoldMap attribute) colormap (hv_anndata.ManifoldMap attribute) create_clustermap_plot() (in module hv_anndata) create_manifoldmap_plot() (in module hv_anndata) create_plot() (hv_anndata.ManifoldMap method) D datashade (hv_anndata.ManifoldMap attribute) datashading (hv_anndata.ManifoldMapConfig attribute) dendrogram (hv_anndata.Dotmap attribute) dendrogram_opts (hv_anndata.Dotmap attribute) dimension_type() (hv_anndata.AnnDataInterface class method) Dims (class in hv_anndata) dims() (hv_anndata.AnnDataInterface class method) Dotmap (class in hv_anndata) DotmapParams (class in hv_anndata) draw_graph() (in module hv_anndata.plotting.scanpy) E embedding_density() (in module hv_anndata.plotting.scanpy) expression_cutoff (hv_anndata.DotmapParams attribute) G GeneSelector (class in hv_anndata) get_dim_labels() (hv_anndata.ManifoldMap method) get_reduction_label() (hv_anndata.ManifoldMap static method) groupby (hv_anndata.Dotmap attribute) groupby() (hv_anndata.AnnDataInterface class method) H heatmap() (in module hv_anndata.plotting.scanpy) height (hv_anndata.ManifoldMap attribute) (hv_anndata.ManifoldMapConfig attribute) highest_expr_genes() (in module hv_anndata.plotting.scanpy) (in module hv_anndata.plotting.utils) highly_variable_genes() (in module hv_anndata.plotting.scanpy) hv_anndata module hv_anndata.plotting.scanpy module hv_anndata.plotting.utils module I iloc() (hv_anndata.AnnDataInterface class method) init() (hv_anndata.AnnDataInterface class method) K kdims (hv_anndata.Dims attribute) (hv_anndata.DotmapParams attribute) L labeller_opts (hv_anndata.ManifoldMap attribute) (hv_anndata.ManifoldMapConfig attribute) legend_alpha (hv_anndata.ManifoldMap attribute) (hv_anndata.ManifoldMapConfig attribute) legend_font_size (hv_anndata.ManifoldMap attribute) (hv_anndata.ManifoldMapConfig attribute) legend_ncols (hv_anndata.ManifoldMap attribute) (hv_anndata.ManifoldMapConfig attribute) legend_position (hv_anndata.ManifoldMap attribute) (hv_anndata.ManifoldMapConfig attribute) ls (hv_anndata.Dotmap attribute) (hv_anndata.ManifoldMap attribute) (hv_anndata.ManifoldMapConfig attribute) M ManifoldMap (class in hv_anndata) ManifoldMapConfig (class in hv_anndata) marker_genes (hv_anndata.DotmapParams attribute) matrixplot() (in module hv_anndata.plotting.scanpy) max_dot_size (hv_anndata.DotmapParams attribute) max_genes (hv_anndata.ClusterMap attribute) mean_only_expressed (hv_anndata.DotmapParams attribute) module hv_anndata hv_anndata.plotting.scanpy hv_anndata.plotting.utils O options (hv_anndata.GeneSelector attribute) P plot() (hv_anndata.Dotmap method) plot_opts (hv_anndata.ClusterMap attribute) (hv_anndata.DotmapParams attribute) (hv_anndata.ManifoldMap attribute) R ranking() (in module hv_anndata.plotting.scanpy) reduction (hv_anndata.ManifoldMap attribute) register() (in module hv_anndata) reindex() (hv_anndata.AnnDataInterface class method) responsive (hv_anndata.ManifoldMap attribute) (hv_anndata.ManifoldMapConfig attribute) S scatter() (in module hv_anndata.plotting.scanpy) scrublet_score_distribution() (in module hv_anndata.plotting.scanpy) select() (hv_anndata.AnnDataInterface class method) selection_masks() (hv_anndata.AnnDataInterface class method) show_labels (hv_anndata.ManifoldMap attribute) (hv_anndata.ManifoldMapConfig attribute) show_widgets (hv_anndata.ClusterMap attribute) (hv_anndata.ManifoldMap attribute) stacked_violin() (in module hv_anndata.plotting.scanpy) standard_scale (hv_anndata.DotmapParams attribute) streams (hv_anndata.ManifoldMap attribute) (hv_anndata.ManifoldMapConfig attribute) T title (hv_anndata.ManifoldMapConfig attribute) tracksplot() (in module hv_anndata.plotting.scanpy) U umap() (in module hv_anndata.plotting.scanpy) unpack_scalar() (hv_anndata.AnnDataInterface class method) use_raw (hv_anndata.ClusterMap attribute) (hv_anndata.DotmapParams attribute) V validate_selection_dim() (hv_anndata.AnnDataInterface class method) values() (hv_anndata.AnnDataInterface class method) var_reference (hv_anndata.ManifoldMap attribute) vdims (hv_anndata.Dims attribute) (hv_anndata.DotmapParams attribute) violin() (in module hv_anndata.plotting.scanpy) W width (hv_anndata.ManifoldMap attribute) (hv_anndata.ManifoldMapConfig attribute) X x_axis (hv_anndata.ManifoldMap attribute) Y y_axis (hv_anndata.ManifoldMap attribute)